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云南是滇重楼的原产区和主产区，种植面积和产量均占全国的90%以上。云南滇重楼产业具有一产强、二产大的特点，产业链完整，产业优势明显。主产区在普洱、红河、曲靖、文山等地。

云南是灯盏花的原产地和主产区，拥有近100%原料种植、97%原料供应、50%产业总产值，孕育了一批龙头企业，产业链长、全、强。主产区在红河、大理、曲靖等地。

云南是我国石斛资源最丰富的省区，是石斛属植物地理分布中心和起源中心，也是铁皮石斛主要产地和道地产区。云南铁皮石斛产量占全国65%以上，从业单位150余家，居全国首位，具有较为完整的产业链。主产区在普洱、文山、保山、德宏等地。

云南是全国最大的砂仁主产区，砂仁种植面积、产量全国第一，云南产砂仁指标成分含量高于其他产区。2022年，云南种植面积99万亩，农业产值16亿元。主产区在西双版纳、红河、文山等地。

云南昭通是全国品质最优良的天麻种植核心区、乌天麻的主产区和天麻道地产区，产量高、质地好，产量约占全国四分之一，是天麻的集中产区之一。另外，玉溪、楚雄等地也种植天麻。

云南是茯苓产出的第一大省，鲜茯苓产出量约占全国总产量的60%以上。云茯苓品质优，多糖含量和浸出物量高，优于其他产地，是业内公认的道地药材。主产区在普洱、楚雄、临沧、大理等地。

云当归产量占全国的20%左右，为全国第二产区，种植面积常年10万亩左右。云当归有效成分高，是云南传统道地药材。主产区在丽江、迪庆、大理、曲靖、昆明等地。

云南是木香的道地产区和主产区，种植历史近100年，云木香种植面积和产量均为全国之首，均占全国50%以上，云木香不仅行销国内，还是云南出口的重要中药材品种之一。主产区在丽江、迪庆、大理等地。

云南是滇龙胆的道地产区和主产区，面积和产量占全国90%以上，云南产滇龙胆龙胆苦苷含量高，品质优良。主产区在临沧、普洱、保山等地。